Pypedaal

PYPEDAL is een Python-module die hulpmiddelen biedt voor de manipulatie van stambomen.
Download nu

Pypedaal Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • LGPL
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • John B. Cole
  • Uitgever website:

Pypedaal Tags


Pypedaal Beschrijving

Pypedaal is een Python-module die hulpmiddelen biedt voor de manipulatie van stambomen. PYPEDAL-project is een Python-module die hulpmiddelen biedt voor de manipulatie van stambomen, eenvoudige visualisatie van stambomen, en de berekening van de maatregelen van genetische diversiteit van stambomen. Wat is er nieuw in deze release: · Toegevoegd PypedAlError en PypedAlediREEInputFileNameError-klassen. Nu de uitzondering opgericht in New Pedigigree :: __ init __ () werkt eigenlijk sort-of corrigs.Did wat meer werk in PYP_NEWCLASSES / newanimal :: __ init __ () om ervoor te zorgen dat stringmethoden niet worden opgeroepen op niet-strings.pyp_newclasses / newanimal :: string_to_int () gebruikt nu een nieuw hash-algoritme van "tekenreekssleutels" in "Data-structuren en algoritmen met objectgeoriënteerde ontwerppatronen in Python" door Bruno R. Preiss: http://www.brpreiss.com/books/opus7 /html/page220.html#progstrnga.Deze fixeert het botsingsprobleem met het vorige algoritme (maar elk algoritme dat produceert, zeg, zegt 32-bits gehele getallen onder de juiste omstandigheden) .OK, het probleem met PYP_UTILS / REORODE () Geïdentificeerd: ORI PELEG's Hashing-aanpak die wordt gebruikt in PYP_NEWCLASSES / NEWANIMAL :: String_to_int () SAMENVANGEN. Bijvoorbeeld, de Snings 'ANJHL5876DC' en 'OnNLDF348RC' hash tot dezelfde waarde.Made een wijziging in PYP_NEWCLASSES / NEWANNAIMAL :: __ init __ (), zodat dier, vader en damnamen correct zijn toegewezen, zelfs als integrale ID's worden gepasseerd in plaats van Strings.PYP_NEWCLASSES / NEWEDUNDIGREE :: PREPROCESS () werpt niet langer dier, vader en dam-ID's naar snaren bij het toevoegen van pedigree-inzendingen voor ontbrekende sires en dammen. De cast was het breken van de oprichter-opdrachtcode in PYP_NEWCLASSES / NEWANIMAL :: __ init __ (). Een aantal foutopsporingsberichten uitgeschakeld in PYP_UTILS / REORDER (). PYP_UTILS / ASSICE_OFFSPRING () Was vrij grondig gebroken als gevolg van fouten die worden ingevoerd als het nieuwe is Object Model Conversion is gemaakt. Wat is nieuw in deze release: 06/26/2007 Meer bugfixes naar PYP_UTILS / REORODE (). Theorderdeiction en orderbackdict-woordenboeken zijn nu correct gecorrigeerd wanneer een dier in de stamboom wordt verplaatst. Deze vaste gevallen waarin de stamboom niet correct werd geregistreerd. Toen dit gebeurde, betrapte PYP_UTILS / Remummer () KeyErrors tijdens het opzoeken van SIRES / DAMS en stel ouders in onbekende, negeerde bekende relaties in de stamboom. George Wiggans's persistent meldingen dat de berekende relaties gewoon niet goed hebben geleid tot de oorzaak van het probleem. Bedankt, George! 06/25/2007 verwijderde PYP_UTILS / REORDER_LIST (). 06/21/2007 PYP_UTILS / REORORD () zal nu foutmeldingen schrijven naar de logfile en STDIO als een stamboom niet kan worden hernummerd in Renumber_Max_ronden van iteratie. 06/21/2007 Toegevoegd aan nieuwe parameter, max_rounds, aan PYP_UTILS / REORORT (). PYP_NEWCLASSES / NEWEDUNDIGREER PASSES RENDER_MAX_RUNDS om opnieuw te ordenen, maar de routines in PYP_NRM / * DO NOT.06 / 21/2007 Toegevoegd nieuwe optie, Renumber_Max_Rounds, aan PYP_NEWCLASSES / NEUWEDIGREE :: __ init __ (). De standaardwaarde is 100 Rounds.06 / 21/2007 Herschreven PYP_UTILS / REORDER (), die al lang de bane van mijn bestaan en bron van de meeste pypedal-bugs is geweest.06 / 21/2007 Fixed Bug in PYP_NRM / Inteelt () Zodat het correct werkt met vooraf berekend NRM.06 / 20- / 2007, heeft een nieuwe functie toegevoegd, PYP_IO / Write_ijk (), die een NRM op een schijf in IJK-formaat bespaart, waar I en J dierlijke ID's zijn en k is ofwel (1. + de coëfficiënt van inteelt) wanneer (i == J) of coëfficiënt van relatie wanneer (i! = j) .06 / 20/2007 een foutmelding in PYP_NEWCLASSES / NEWEDEDIGRERE REKEN dat het nu logisch is.


Pypedaal Gerelateerde software

Emaans

EMAN is een reeks wetenschappelijke beeldverwerkingshulpmiddelen die voornamelijk zijn gericht op de transmissie-elektronenmicroscopie-gemeenschap. ...

71

Downloaden

Kayali

Kayali is een QT-gebaseerd computer algebra-systeem (CAS) dat ook kan worden gebruikt als een geavanceerde vervanging voor KDE KCALC. ...

60

Downloaden

kom tot rust

Ontspannen is ontworpen voor de studie van de dynamiek van eiwitten of andere macromoleculen, hoewel de analyse van NMR-ontspanningsgegevens. ...

180

Downloaden