Epos Een modulair softwarekader voor fylogenetische analyse en visualisatie.
Download nu

Epos Rangschikking & Samenvatting

Epos Tags

analyse visualisatie fylogenetisch fylogenetische analyse fylogenetische visualisatie fylogenetische software

Epos Beschrijving

Een modulair softwarekader voor fylogenetische analyse en visualisatie. We presenteren EPO's, een modulair softwarekader voor fylogenetische analyse en visualisatie. Bestaande fylogenetische software kan worden opgesplitst in twee groepen. Algoritmische pakketten die computationele methoden bieden voor een specifiek probleem en visualisatietools om resultaten te analyseren. Veel algoritmische gereedschappen ontbreken in de bruikbaarheid, omdat ze vaak opdrachtregel zijn gebaseerd, terwijl visualisaties vaak last hebben van slechte grafische gebruikersinterfaces. EPOS vult deze kloof door een krachtige grafische gebruikersinterface te combineren met een plug-in-systeem waarmee een eenvoudige integratie van nieuwe algoritmen, visualisaties en data-structuren kunnen worden gebruikt. Een consistente interface wordt gebruikt om gegevens te beheren of om de beschikbare computationele methoden te starten, de werkstroom uit de gegevens te starten. of toegepaste methoden. Momenteel biedt EPO's algoritmen voor op afstand gebaseerde boomreconstructie, boomafstanden, consensusbomen en Supertree-methoden. Alle methoden zijn geïntegreerd in een pijplijnsysteem waarmee combinaties van methoden die achtereenvolgens worden uitgevoerd, waarbij de gegevensstroom automatisch door het systeem worden afgehandeld. Een uitgebreide boomweergave is opgenomen in EPO's. Het biedt verschillende lay-outs, colorisatie, annotatie en exportfuncties en kan soepel bomen maken tot een paar duizend bladeren. Omdat visualisaties deel uitmaken van het modulaire systeem, kunnen ze in elke richting worden uitgebreid en kunnen nieuwe visualisatiemodules worden geïntegreerd om te hanteren, zeggende fylogenetische netwerken. Om de gegevensverwerking te vereenvoudigen, kan EPOS de gebruiker een aanhoudende werkruimte maken die alle gebruikte gegevenssets bevat. De informatie binnen de werkruimte is volhardend opgeslagen in een uitbreidbare en transparante backend-module.Requirements: · 256 MB, betere 512 MB gratis RAM Wat is er nieuw in deze release: · Bevat geen nieuwe functies, maar repareert enkele van de meest geërdo-bugs, waaronder "Gebruik geen spaties in uw installatiepad" -probleem.

Epos Gerelateerde software