Koriblast biedt verschillende grafische gebruikersinterfaces en analysetools om gemakkelijk te bekijken en om ontploffingsresultaten te verkennen.
Download nu

Koriblast Rangschikking & Samenvatting

Koriblast Tags

ONTPLOFFING vraag resultaat data analyseren Blast-motor query resultaat

Koriblast Beschrijving

Biedt verschillende grafische gebruikersinterfaces en analysetools om gemakkelijk te bekijken en om ontploffingsresultaten te verkennen. Koriblast is een betrouwbare grafische omgeving die is gewijd aan sequentie datamining. Koriblast combineert Blast-zoekopdrachten met geavanceerde gegevensbeheermogelijkheden en een state-of-the-art grafische gebruikersinterface. Koriblast biedt een grafische Blast-planner in staat om tegelijkertijd meerdere querysequenties te vergelijken met meerdere sequentiedatabases met behulp van een netwerk of een lokale blastmotor. Koriblast biedt verschillende grafische gebruikersinterfaces en analysetools om gemakkelijk te bekijken en explorderen van explosies op zinvolle manieren, het faciliteren van de interpretatie van de gegevens. Bovendien is Koriblast in staat om gegevens automatisch uit NCBI Entrez-databases op te halen, waardevolle informatie rechtstreeks in de grafische BLAST-rapporten te integreren. Ten slotte kunnen alle informatie van Koriblast worden opgevraagd, zodat u snel relevante informatie kunt vinden terwijl u het aantal gegevens tot analyse wordt verkleind .Note: om een licentietoets te downloaden en te ontvangen waarmee u de toepassing kunt uitvoeren, moet u zich registreren. Hier zijn enkele belangrijke kenmerken van "Koriblast": · Een vriendelijke en gemakkelijk te leren grafische software. · Een Blast-planner om te zoeken met meerdere querysequenties tegen meerdere databases tegelijkertijd. · BLAST-query's worden uitgevoerd met behulp van de NCBI BLAST-server of een lokale installatie van BLAST. · Slimme geïntegreerde grafische analyse-instrumenten die een zeer efficiënt BLAST-mijnsysteem bieden. · Importeer aanvullende gegevens (bekende hits-functies) door een directe en transparante toegang tot biologische gegevensbronnen. · Geïmporteerde gegevens zijn: geïntegreerd in Blast-resultaten, weergegeven in grafische rapporten, beschikbaar om de resultaten van het ontploffing te filteren. · Lokaliseer relevante informatie met behulp van filters. · Verlaag de hoeveelheid gegevens om te analyseren met behulp van filters. · Gegevens die zijn opgeslagen op de schijfstation van de gebruiker, blijven in de loop van de tijd beschikbaar. · Exporteren gegevens naar spreadsheet-applicaties. · Volledige hit-sequenties ophalen van externe sequentiedatabases. · Volledige hit-sequenties exporteren naar FASTA-bestanden. · Re-Blast eerdere BLAST-query's met een enkele muisklik. · Revlust Volledige Hit-sequenties met een enkele muisklik. · Toon volledige hit-vermeldingen met uw favoriete webbrowser. Vereisten: · PowerPC (G3 of nieuwer) of Intel Pentium-processor. · Een Java-virtuele machine (JVM) 1.5.0 of hoger. · Ten minste 128 MO van RAM (256 mo aanbevolen). · Een schermresolutie van 1024 met 728 pixels. Beperkingen: · 14 dagen proefperiode. Wat is er nieuw in deze release: · PSI-BLAST-zoekopdrachten zijn verkrijgbaar bij de zoekmodule en de analysemodule is aangepast om uitgebreide analyse van de resultaten mogelijk te maken (zie onderstaande afbeelding en deze video bekijken). · Bereid Personal Blast-databanken voor van Native Genbank, Genpept, EMBL, SwissProt en UNIPROT-bestanden, met behulp van platte tekst of gecomprimeerde gecomprimeerde bestanden (bekijk deze video). · Installeer vooraf geformatteerde NCBI BLAST-databanken rechtstreeks van hun native 'TAR.GZ' -bestanden (bekijk deze video). · Ontwerp zoekfilters die patroon matchen op klapsequenties. · Vergelijk zoekresultaten om nieuwe, gemeenschappelijke of verwijderde treffers vinden. · Export KoriBlast gegevensbestanden en filters om te delen met collega's die KoriBlast of BlastViewer. · Nieuwe Sequence Viewer om te laten zien en te manipuleren sequenties (extract, vertalen, krijgen composities) gedownload van de openbare repositories (zie onderstaande figuur). · Betere afhandeling van grote projecten waarbij duizenden sequenties.

Koriblast Gerelateerde software