Marvin gratis download, Marvin download op software download

Een ongelooflijke Java gebaseerde chemie software die je zeker zal helpen bij je onderzoek. Marvin is een op Java gebaseerde chemie software, verkrijgbaar in verschillende vormen: · Marvin applets worden gemaakt voor de Web Developer die chemische Internet / Intranet websites bouwt. Het pakket bestaat uit: · MarvinSketch / Swing en MarvinView / Swing: applets voor het bewerken en visualiseren van moleculen op een webpagina. Ze worden vertrouwd, dus ze mogen lokale middelen te gebruiken, bijv. geopende bestanden op de lokale computer, om het bestand op te slaan op de lokale machine, gebruik van het systeem klembord van de lokale machine · Java, JavaScript en C bron voor Molfile compressie · Marvin Bonen zijn gemaakt voor de Software Developer molecule tekening of het visualiseren van mogelijkheden op te nemen in een Java-applicatie. Het pakket bevat MarvinSketch en MarvinView als JavaBeans. · MarvinSketch en MarvinView zijn applicaties voor de Chemist of iemand anders die wil om te tekenen of te bekijken chemische structures.Marvin aankan moleculen in verschillende bestandsformaten, waaronder MDL mol, Compressed mol, uniek SMILES, CML, XYZ, SMARTS, Sybyl mol, PDB, POV-Ray.The Marvin applets ondersteunen een breed scala aan Java platforms, van Java 1.3.1 tot en met de laatste versies. Ze werken in oudere webbrowsers, maar als ze zich in een moderne browser, ze automatisch gebruik maken van nieuwere Java features.Marvin is zeer configureerbaar en bestuurbaar via applet parameters en Java / JavaScript-methode calls.MarvinSketch heeft vele geavanceerde functies zelden of nooit gevonden in andere programma's, zoals de recente structuren, visuele fragment plaatsing, dubbelzinnigheid reductie, en multi-level undo / redo. MarvinSketch was de eerste structuur tekenprogramma om visuele fragment plaatsing (1998) en de recente structuren (1999) introduceren .MarvinView kan een 2D of 3D molecule, of vele moleculen in een tabel weer te geven. tekstlabels, knoppen, selectievakjes: Een molecuul tabel kan ook GUI-componenten bevatten. Checkboxes en knoppen kunnen JavaScript-oproepen van de Java-applet, buttons kan ook leiden tot CGI script laden activeren. De applet heeft een pop-up menu, maar de gebruiker kan ook een molecuul in een apart venster dat een gewone menu bar heeft. Een venster kijker kan gemakkelijk worden omgezet in een MarvinSketch venster, zodat de gebruiker zelfs de molecuul kan bewerken (s) .Marvin kan worden uitgerust met aangepaste chemische rekentools door de geïntegreerde plugin diensten. Plugins zijn dynamisch geladen op verzoek besparen download tijd en het systeem resources.NOTE: U moet zich registreren op de website van de ontwikkelaar om hier te downloaden zijn een aantal belangrijke eigenschappen van "Marvin": Alle drie de programma's zijn beschikbaar in twee vormen: · Applet te bewerken en te visualiseren structuren op een webpagina · Standalone Java-toepassing · MarvinSketch en Marvin uitzicht support · Stereochemie, · Verkorte groepen en meerdere groepen, · Reacties, · 2D- en 3D-reiniging, · Isotopen, · Het weergeven van impliciete H atomen, · Aromatisering en dearomatisering van moleculen. Plugins zijn beschikbaar: · Elementenanalyse plug · Protonering: pKa, Major microsoort, iso-elektrisch punt · Partitioning: logP, logD · Charge: Charge, polariseerbaarheid · Isomeren: Tautomeren, Resonance, Stereo-isomeren · Bevleesdheid: Conformers, Molecular Dynamics · Geometrie: Analyse topologie, geometrie Polar Oppervlakte (PSA), Molecular Oppervlakte (MSA) · Overige: Hydrogen Bond donor-acceptor (HBDA), Huckel- Analysis, refractivity · Import / Export functies in MarvinSketch en MarvinView · Verschillende molecule bestandsformaten worden ondersteund. · Het molecuul bestand kan ook worden bekeken of bewerkt niet-grafisch, in een van deze tekst gebaseerde formaten. · JPEG, PNG, PPM en SVG image export. · Andere mogelijkheden · Kopiëren en plakken, slepen en neerzetten (in de Swing-versie). · Applet parameters om het uiterlijk aan te passen MarvinSketch: Chemisch intelligent: · Sets kosten en impliciete H-atomen volgens valence regels als u tekent · Waarschuwt voor Valence fouten · Periodiek systeem · Snelle toegang tot Template structuren. · Het maken van door de gebruiker gedefinieerde templates door te slepen en neerzetten op template knoppen. ONDERBOUW zoeken steun: · Query atoom types: "elk atoom", "heteroatoom" atoom lijst, 'NOT' list, SMARTS atoom · Query bindingstypes: "alle", "één of twee", "één of aromatisch", "double of aromatisch", bond topologie ( "chain", "ring"), laten reageren center ( "center", "make or break ", "change", "merk en change", "niet center"), SMARTS bond uitdrukkingen (kenmerken: - = #: en, / / @)!? · Smarts-eigenschappen: waterstoftelling, valentie, verbindingen (x), ringtelling, ringlidmaatschap, kleinste ringmaat, aromatisch en alifatisch. Graad, impliciete waterstofcellen · Smarts Atom Expressions: logische uitdrukkingen (; en,!), Recursieve Smarts ($ ()) · R-groepen, R-Group-omstandigheden. Ondersteuning van groepscreatie: · Ontkoste groepen en meerdere groepen (met herhaalde telling). · Grafische objecten kunnen worden geplaatst: lijnen, bogen, pijlen, rechthoeken, tekstvakken. · Slimme gebruikersinterface · Pop-upmenu's. · Multi-level ongedaan maken / opnieuw. · Selectie rechthoek en lasso. · Zoom in en uit. · Maximumable weergavegebied (visualisatiemodus). · Afneembaar vanaf de webpagina. · Alternatieve lay-out. · Slimme rotatie van · Sjabloonknoppen bij het slepen, · Sjablonen bij het verbinden, · Selectie. · Vertakkend bij een enkele klik · Eenvoudig te halen toetsenbordsnelkoppelingen voor · Alle elementtypen (C voor koolstof, C-L voor chloor, enz.), · 8 obligatietypen (1 voor single, 2 voor dubbel, 1-2 voor "single of double", enz.), · Ontkoste groepen, · Sjablonen, wismodus, ongedaan maken, opnieuw doen, enz. · Horizontale / verticale uitlijning aan gespecificeerde obligatie. · Horizontale / verticale flipping. · Multipage moleculair document voor het afhandelen van grote documenten. · Recente structuren · Laatste sjablonen, atoomtypen, kopiëren / geplakte onderdelen zijn snel toegankelijk (vanuit het pop-upmenu), om de creatie van veel vergelijkbare moleculen te verlichten. · "Real-time reiniging" · Gekwantiseerde hoeken en lengtes, · Slimme fragment-plaatsing en verplaatsing - Automatische beweging / rotatie om bij elkaar te komen, · Smeden nauwe atomen, · Verwijdert dubbelzinnige obligaties. · Visuele fragment plaatsing · Sjablonen worden onmiddellijk weergegeven na het oppakken. · Markeert de toetredingspunten, · De atomen die moeten worden samengevoegd en · De obligaties die moeten worden verwijderd. · Aanpasbaar · Maak uw eigen sjablonen. · Gebruik van atoom- en obligatietypen kan worden toegestaan of niet toegestaan. MarvinView: 3D-functies: · Wireframe, "Ball and Stick", Space Fill Dendering Styles, · Geanimeerde 3D-rotatie, · Geanimeerde XYZ-bestanden, · Animatie besparen in een reeks beeldbestanden (alleen in de toepassing), · Obligaties kunnen worden geregenereerd met door de gebruiker opgegeven cut-off lengte (alleen in de swing-versie) · Molecuulafels voor snelle weergave van veel zoekresultaten in één applet. · Door de gebruiker gedefinieerde labels, knoppen, selectievakjes, afbeeldingen. · CGI- of Javascript-oproepen geactiveerd door de drukpersen en checkbox-statuswijzigingen. · Inzochten van moleculen in afzonderlijke vensters. · MarvinSchetch kan worden gelanceerd om het bekeken molecuul te bewerken. · Popup menu. Marvinspace: · 3D-visualisatie van moleculen · Tekentypen: Wireframe, bal, stick, ruimtevorm · Kleurmodi: CPK, residu, ketting, constant · Labels: atoometiketten, residu-labels, secundaire structuurlabel, bewerkbare labels, labelkleuring · Eigenschap-instellingen: Radii, kleuren, kleurenschema's, bedieningssleutels, muisbesturing · Verbeterde visualisatie · Optionele dieptecue, interactieve besturing van miststart en mist-uiteinde · Knippende vliegtuigen, interactieve vertaling van bijna en ver uitknippvlakken · Lijn en poligon anti-aliasing · 3D-manipulatie · Scène: rotatie, vertaling en zoom · Component: vertaling, rotatie, schalen · Individuele componentselectie, verbergen, laten zien, verwijderen, vervagen · Meerdere cellenweergave, synchronome transformaties van cellen · Monitoren en controles · Geometrie-metingen: Afstanden, Bondhoek, Dihedral Angle · Besturing: Vertalen, draaiende moleculen afzonderlijk, verander de dihedrale hoek interactief · Alle monitoren worden vernieuwd terwijl componenten of bedieningselementen worden gewijzigd · Macromoleculen · Componentherkenning en classificatie: kettingen, liganden, ionen, watermoleculen · Gemakkelijke toegang tot individuele componenten · Visualisatie van secundaire structuur (cartoon, lint) en kleuren · Moleculaire oppervlakken · Diverse oppervlaktetypes: van der Waals, oplosmiddel toegankelijk, connollig oppervlak; Blobby Surface · Snelle oppervlakteberekening, nauwkeurige vertegenwoordiging · Verschillende weergavemodi: gestippeld, mesh, gevuld, transparant · Kleurplaten: per atoomtype, residu-type, kettingtype, b-factor en andere atomaire eigenschappen; elektrostatisch potentieel en andere volumetrische gegevens · Klantgerichte vastgoedmapping, eigendom Interpolatie, accommodatie Superpositie, kleurenblending · ISO-oppervlakken, interactieve cut-off Wat is er nieuw in deze release: Nieuwe functies en verbeteringen: · MarvinSchetch · Pijlengroep wordt geherstructureerd in de werkbalk en in het menubar (Forum Topic). · Het menu Invoegen> Groepen wordt vervangen door een handiger dialoogvenster. · Importeren / exporteren · Unieke glimlachen moeten effen hydrogenen (forumonderwerp) impliciet. · Calculator-plug-ins · Unieke Markush-code kan worden gegenereerd voor elke opgesomde structuur. · LogP en Logd-berekeningen zijn aanzienlijk sneller. · API · Nieuwe methoden in Chemaxon.Beans.mviewPane: ISViewWindOoped (INT), ISSKETWINDOPOPEND (INT) EN CONTROLEKETCHER (INT). · Pdbreader en gerelateerde klassen werden verplaatst van chemaxon.modules naar chemaxon.marvin.io.formats.pdb. · Macromolecule en gerelateerde klassen werden verplaatst van chemaxon.modules naar chemaxon.struc. Bugfixes: · MarvinSchetch · De lay-out van de kopie als ... Dialoogvenster is gepolijst. · Periodieke systeemknop bleef ingedrukt op de werkbalk, zelfs nadat het dialoogvenster werd gesloten. · Het Atoom> Stereo> Verbeterd, Atom> Laad, Atom> Kaart, Atom> R-Group Menu's worden vervangen door meer handige dialoogvensters. (Forum onderwerp) · Ctrl + Del in MarvinSchetch heeft geen eigenschappen verwijderd. · Licenties · De opdrachtvergunning -L produceerde slechte output, geen goed geïnstalleerde licenties vermeldt. · Calculator-plug-ins · Wanneer u calculator-plug-ins gebruikt, verschijnt het resultaatvenster van een eerdere berekening soms opnieuw (forumonderwerp). · Huckel-analyse-plug-in gooide uitzondering als het ingangsmolecuul expliciete hydrogenen bevatte.

Marvin Gerelateerde software