Mpex Rangschikking & Samenvatting
- Uitgever website:
- http://blanco.biomol.uci.edu
- Besturingssystemen:
- Mac OS X
Mpex Tags
Mpex Beschrijving
Tool om de topologie van membraaneiwitten te verkennen MPEX is een gratis en gemakkelijk te gebruiken hulpmiddel voor het verkennen van de topologie en andere kenmerken van membraaneiwitten door middel van hydropathie-plots op basis van thermodynamische en biologische principes.PEX is ontworpen voor onderzoek van membraaneiwitsequenties met behulp van hydropathische plotmethoden die door Kyte en Doolittekens worden gepopulariseerd (1982). Dat wil zeggen, het is gebaseerd op schuifraamanalyse die een aminozuursequentie voorstelt als een reeks getallen die fysieke of statistische eigenschappen van de aminozuursequentie vertegenwoordigen. De meest voorkomende fysieke eigenschap is hydropathie, die is gebaseerd op de vrije energie van partitionering van aminozuren tussen water en membraan. Deze versie van MPEX gebruikt twee soorten hydropathie-schalen: op experiment gebaseerde whole-residu-afscheidsschalen bepaald in deze biologische schubben van het laboratorium- en experiment-gebaseerde schubben bepaald in samenwerking met het Von Heijne-laboratorium aan de Universiteit van Stockholm. Vereisten: · Java 1.6 of later
Mpex Gerelateerde software