Schroeven
Een open source-programma voor de karakterisering van eiwitsecundaire structuren ...
21 KB
 | PalmaMRNA voor genoele uitlijningen met behulp van grote marge-algoritmen |
| Download nu | |
Palma Rangschikking & Samenvatting
Advertentie
- Vergunning:
- GPL
- Prijs:
- FREE
- Naam uitgever:
- Friedrich Miescher Laboratory
- Uitgever website:
- http://www.fml.tuebingen.mpg.de/fml
- Besturingssystemen:
- Mac OS X
- Bestandsgrootte:
- 4.4 MB
Palma Tags
Palma Beschrijving
MRNA tot genome uitlijningen met behulp van grote marge-algoritmen Palma lijnt twee genomische sequenties op een optimale manier uit volgens zijn onderliggende algoritme en getrainde parameters. Het belangrijkste Python-script neemt twee FASTA-bestanden met het doelwit (bijvoorbeeld een DNA-sequentie, een deel van het genoom) en querysequenties (bijvoorbeeld een cDNA of EST-sequentie). Palma creëert een uitlijning met behulp van dynamische programmering (geschreven in C ++) en retourneert de uitlijning in een PSL-indeling. De algoritmen zijn degenen die optimale lokale uitlijningen zullen berekenen, dus als er geen uitlijning is gevonden, is het omdat er geen uitlijning een voldoende hoge uitlijnscore kreeg. Vereisten: · Shogun · Python
Palma Gerelateerde software
Aspectie
Gratis pijpleiding die u zal helpen bij het verwerken van Geneseqer / GMAP-uitlijningen ...
1.5 MB
ruby-nxt
RUBY-interface voor het besturen van de LEGO MINSTSTORMS NXT Robotics Kit via Bluetooth ...
36 KB
Bovenste lade
Gratis en Open Source Utility die u zal helpen om Euclidische geometrie-diagrammen te maken ...
22 KB