Pls en npairs analyse

De PLS (gedeeltelijke Middeleques) en NPAIREN (niet-parametrisch, voorspelling, activering, invloed, reproduceerbaarheid, re-sampling) Neuroimaging-softwarepakket ontwikkeld op het Rotman Research Institute
Download nu

Pls en npairs analyse Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • GPL
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • Baycrest
  • Uitgever website:
  • http://www.rotman-baycrest.on.ca
  • Besturingssystemen:
  • Mac OS X
  • Bestandsgrootte:
  • 1 KB

Pls en npairs analyse Tags


Pls en npairs analyse Beschrijving

De PLS (gedeeltelijke vierkanten) en npairs (niet-parametrisch, voorspelling, activering, invloed, reproduceerbaarheid, re-sampling) neuroimaging softwarepakket ontwikkeld op het Rotman Research Institute PLS en NPARES-analyse is een reeks gereedschappen die in wetenschappelijke doeleinden kunnen worden gebruikt. Gedeeltelijke vierkanten (pls), werd voor het eerst geïntroduceerd bij de neuroimaging-gemeenschap in 1996 (McIntosh et al., 1996), voor het meten van gedistribueerde taakreacties (gemiddelde centrering pls en niet-geroteerde taak pls). Pls is ook toegepast op het meten van gedistribueerde patronen die van invloed zijn op taakprestaties (regelmatig gedrag, niet-geroteerd gedrag en multiBlock pls) en uiteindelijk op zowel taakafhankelijke en rustgevende staatsconnectiviteit (McIntosh en Lobugh, 2004) .De NPairs (Niet-parametrisch, voorspelling, activering, invloed, reproduceerbaarheid, re-sampling) Pakket werd voor het eerst geïntroduceerd met Canonical-variaties-analyse (dwz lineaire discriminantanalyse) en een reproducibilty-status (Strother et al., 1997) gevolgd door de toevoeging van voorspellingsstatistieken ( Strother et al., 2002). NPARS maakt gebruik van een gestrafte PCA-basis (PCA Denoising) aangepast om de reproduceerbaarheid en voorspellingsstatistieken voor CVA te optimaliseren. Naast het meten van gedistribueerde taak en ruststaatsreacties verschaft NPairs een statistisch resamplankramework met elementaire bouwstenen voor benchmarking en vergelijking van preprocessing- en gegevensanalyse, (dwz het verwerken van pijplijn) keuzes (Strother et al., 2004) .both pls en nl. CVA heeft gebleken robuuste methoden voor het extraheren van gedistribueerde signaalwijzigingen die verband houden met veranderende taakvereisten in neuroimaging. Hun relatieve sterke punten en zwakheden worden momenteel geëvalueerd aan het Rotman Research Institute. Vereisten: · Java 1.6 of later Wat is er nieuw in deze release: · NPairs Group Partitioning Bug Fixed: Nu werkt het zelfs in het geval dat proportionele groepsverdelen leidt tot fractionele aantallen objecten in een partitie, b.v. Als er 2 groepen van 5 worden gepartitioneerd in gesplitste helften (dus zou een eenvoudige proportionele splitsing leiden tot 2,5 leden van elke groep in elke splithelft), wordt nu een groep willekeurig gekozen om te worden vergroot (tot 3) en de andere gedefinieerd (tot 2) en vice versa voor de andere splithelft. · NPairs GUI verbeterd om compatibel te zijn met meer omgevingen: PC-bereik 'Step' -veld moet nu zichtbaar zijn in Mac OS X en Ubuntu. · Pls Gedrag Bootstrap Bug (Off-by-One Indexing Fout) Fixed. · Optie toegevoegd aan NPairs om 'Run' in plaats van 'sessie' te gebruiken als 'gesplitst object' (d.w.z. splitsingseenheid) bij het resampling van gegevens. Er is een nieuw vervolgkeuzemenu in het venster Analyse Setup, zodat de gebruiker SPLIT-Object opgeven (standaard is nog steeds 'sessie'). Deze functie is toegevoegd aan de GUI, maar is nog niet opgenomen in Command-Line (Batch) PLSNPAIREN-gereedschappen. · NPAIEN: Conditienummer van binnen-Klasse CVA COPARIUSCE MATRIX W wordt nu altijd gecontroleerd en waarschuwing wordt afgedrukt op analyse-logbestand als COND (W)> 1000. (Voorwaarde Nr. Is de verhouding van de hoogste tot laagste eigenwaarde in de spectrale ontleding van de hoogste eigenvalue. W; hoe hoger de voorwaarde nr., Hoe dichterbij W-singulariteit is.) · NPAIEN CVA CHI-SQUARED COMPUTATION COMMERMENTIE VASTGESTELD: Nu als CDF-berekening niet convergeert voor invoerwaarden die te hoog zijn (en boven de kritieke waarde voor standaard P-value-drempel van 0,95), wordt de bijbehorende Chi-Squared P-waarde opgeslagen uitvoerbestanden als 1.0. · NPAIEN CVA R2-waarden opgeslagen in resultaten .MAT-bestand als: npairs_result.r2_full_data (nr. PC DIMS RIJS X NR. CV DIMS COLS) EN MLCELL NPAIRS_RESULT.R2_SPLITS: één cel / cv DIM en elke cel met (nr. Splits) rijen X (nr. PC DIMS) COLS. Ook opgeslagen als tekstbestanden met achtervoegsel '.R2'. R2-waarden worden berekend tussen CVA Canonical-scores voor elke CV DIM- en INPUT-gegevenstijden (b.v. PCA DIMS) om goedheid te bepalen tussen elke CV-dimensie en invoer (PCA) DIMS. · Geblokkeerde pls-resultaten opgeslagen met achtervoegsel _bfmriresult.mat om matlab pls uitgangssyntaxis te matchen. Nu herkennen Results Viewer welke sessiebestanden en -datamats overeenkomen met een gegeven geblokkeerde pls-analyse. · Gemeenschappelijk (taak) PLS PLS PAUTUTUTS BUG VAST: NU RESULTATEN Gegevens die geannuteerde (enkelvoudige) waarden groter zijn dan waargenomen, moeten correct zijn.


Pls en npairs analyse Gerelateerde software

Biococoa

Open source, Objective-C Framework voor het parseren en schrijven van sequence-bestandsindelingen ...

135 803 KB

Downloaden