| Systems Biology Workbench GRATIS, open source en eenvoudig raamwerk voor applicatie Intercommunications |
Download nu |
Systems Biology Workbench Rangschikking & Samenvatting
- Naam uitgever:
- The SBW Team
- Besturingssystemen:
- Mac OS X 10.5 or later
Systems Biology Workbench Tags
Systems Biology Workbench Beschrijving
Gratis, open source en eenvoudig kader voor applicatie Intercommunications Systems Biology Workbench (SBW), is een softwarekader waarmee heterogene toepassingscomponenten-geschreven in diverse programmeertalen kunnen worden geschreven en op verschillende platforms wordt uitgevoerd - om te communiceren en elkaars mogelijkheden te gebruiken via een snel binair gecodeerd berichtsysteem. Systems Biology Workbench's doel is om een eenvoudige, hoge prestaties, open software-infrastructuur te creëren die gemakkelijk te implementeren en te begrijpen is. SBW maakt toepassingen mogelijk (mogelijk uitgevoerd op afzonderlijke, gedistribueerde computers) om te communiceren via een eenvoudig netwerkprotocol. De interfaces met het systeem zijn ingekapseld in client-side-bibliotheken die we bieden voor verschillende programmeertalen.SBW bestaat uit twee componenten, een makelaar voor routering berichten en modules die berichten verzenden en ontvangen. Alle verbindingen tussen modules en een makelaar zijn via standaard TCP / IP-aansluitingen. Alle berichten worden in een binair formaat verzonden voor maximale prestaties. Als een bericht moet worden verzonden tussen twee verschillende computers, worden berichten eerst verzonden naar de makelaar op de externe machine, dit routeert op zijn beurt het bericht naar de juiste externe module.modules Kan in verschillende talen worden geschreven, waaronder C / C, Java, Perl, Python, Delphi en Matlab.Note: SBW wordt vrijgegeven onder de BSD-licentie. Wat is er nieuw in deze release: Conservation-analyse: · Herschreven van conserveringsanalyse-tool, wat betere prestaties en betrouwbaarheid oplevert Clapack-module: · Herschreven Clapack-module voor betere prestaties en betrouwbaarheid C # Inspecteur: · Laat het invoeren van complexe arrays complexe nummers opgeven met behulp van het formaat: '(' '+' ') · Verbeteringen met uitzonderingsroutering en optimalisatie van UI Structanalysis UI: · Kleine oplossingen voor het omgaan met ongeldige SBML Jarnac: · Vaste regioafhandeling van nummers · Sta het laden van SBML rechtstreeks in de editor met Auto Vertaling naar Jarnac. · Slice (Matrix-, LowerIndex-, UpperIndEX-functie) toegevoegd om het eenvoudig te maken om rijen uit een matrix te ontbinden. · Toegevoegde Timeslice (M, lowertime, Supply) -functie) Dit is toegevoegd om de nieuwe stochastische simulatiefuncties te ondersteunen en stelt een gebruiker in staat om gegevens uit een stochastische simulatie tussen twee tijdspunten te extraheren. De gegevens moeten worden gegenereerd uit een van de Gillxxx-simulatie-oproepen. De functie gaat ervan uit dat eerste kolom van de gegevens de tijdvariabele is. · Een aantal nieuwe functies toegevoegd om de Gilldm-module in SBW te bellen. Deze vergunningen · Toegang tot een must-snellere en volledig geteste stochastische simulator, nieuwe methoden omvatten: Gillloadsbml (SBMLST): bijv. Gillloadsbml (P.XML) Gillsimulate (starttijd, eindtijd, periodensize): instellen Periode Grijpt op één om alle gegevens GillsimulateGrid (starttijd, Entime. Gridsize) GillsimulatemeanonTrid (starttijd, eindtijd, gridsize, populatie): simuleert een populatie van runs op een raster en retourneert het gemiddelde traject. GillsimulatemeanAndsdongrid (starttijd, eindtijd, gridsize, populatie): hetzelfde als vorige, behalve dat het ook de standaarddeviatie in de loop van de tijd voor elke soort retourneert. Setzaad (zaad): Stel het willekeurige nummerzaad in, maakt het mogelijk om exact te worden herhaald. (Zaad moet een geheel getal zijn). · FAST-BUG IN TOEGANG OP SBW-MENU. · PDF (M) -functie toegevoegd. Hierdoor berekent de functie waarschijnlijkheidsdichtheid voor de gevraagde vector die in de functie wordt verstrekt. · Grafhist toegevoegd (M) Dit is hetzelfde als grafiek, maar plotsert in plaats daarvan een histogram in plaats van een lijngrafiek.
Systems Biology Workbench Gerelateerde software