Caryoscoop Visualisatie van expressiegegevens in een hele genoom-context.
Download nu

Caryoscoop Rangschikking & Samenvatting

Caryoscoop Tags

kijker Bekijk gengegevens expressiegegevens

Caryoscoop Beschrijving

CARYOSCOPE is een herbruikbare JAVA UI-component en een reeks parserende hulpprogramma's, opdrachtregelhulpmiddelen en een toepassing GUI voor het bekijken van genexpressiegegevens in een hele genoom-context. CARYOSCOPE is een softwarepakket waarmee u numerieke gegevens kunt weergeven en onderzoeken als een functie van genomische positie. Caryoscoop is bijvoorbeeld gebruikt om "microarray-gegevens" te tekenen, zodat veranderingen in het DNA-kopieummer gebieden van chromosoomverlies of duplicatie in het genoom van tumorcellen kunnen identificeren (NAT genet. 1999 september; 23 (1) : 41-6). Bovendien kunnen microarray-gegevens meten MRNA-expressieniveaus ook worden gevisualiseerd in een genomische context met behulp van caryoscoop (PNAS 2002 dec 10; 99 (25): 16144-9). Gegevens bekeken met Caryscope hoeven niet te worden beperkt tot microarray-gegevens - elk type numerieke gegevens dat kan worden weergegeven als een functie van genomische positie kan worden gevisualiseerd met behulp van caryoscoop. Krijg Caryoscope en probeer het eens te zien waar het allemaal om draait!

Caryoscoop Gerelateerde software