FASTA-bestandsvergelijking

vergelijkt eiwitsequenties van verschillende FASTA-bestanden
Download nu

FASTA-bestandsvergelijking Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Naam uitgever:
  • Pacific Northwest National Laboratory
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 174 KB

FASTA-bestandsvergelijking Tags


FASTA-bestandsvergelijking Beschrijving

FASTA-bestandscompetent is een nuttig hulpprogramma dat is ontworpen om delen van de eiwitsequenties van twee FASTA-bestanden te vergelijken en de bijpassende eiwitten en reeksen te schrijven naar een uitvoertekstbestand. De gebruiker moet de lengte van residuen opgeven om te gebruiken bij het vergelijken van de twee eiwitbestanden. Het uitvoerbestand bevat de namen van de eiwitten met gemeenschappelijke resten, de daadwerkelijke residuen die gemeenschappelijk zijn en de eiwitbeschrijvingen voor elk eiwit (zoals gelezen van het FASTA-bestand). De functionaliteit van dit programma is een simplistische versie van het explosie-algoritme, waar de eiwitten identieke aminozuurgebieden moeten hebben (in plaats van vergelijkbare homologie, die de bedoeling is van BLAST).


FASTA-bestandsvergelijking Gerelateerde software