Oslay

Sequence Matching MAAK MAAKT EASY.
Download nu

Oslay Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Daniel C. Richter
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 2.8 MB

Oslay Tags


Oslay Beschrijving

OSLAY is een handig stuk software dat is ontworpen om synteny tussen overeenkomende sequenties in een doelwitsamenstel en een referentiesamenstel te gebruiken om de contigingen (of steigers) in het doelwitsamenstel op te leggen. Het gereedschap biedt een interactieve visualisatie van de berekende lay-out en het resultaat kan worden geïmporteerd in het tool van de montagebewerking dat moet worden gesteund om het ontwerp van primerparen voor gap-sluiting te ondersteunen. Opmerking: gratis voor academische doeleinden. Belangrijkste kenmerken: leest twee FASTA-bestanden (Contigs of Target Assembly and Reference Sequence / Assembly) en One Blast / Nucmer-bestand is in staat om beide assen tegelijkertijd te sorteren en te bestellen als doel- en referentiesequenties onvoltooide assemblages zijn is van toepassing op procaryotische en eukaryote genomes heeft verschillende mogelijkheden om gegevens te filteren en aan te passen, zoals het trimmen van ongeëvenaarde contig uiteinden, het filteren van Blast-hits, ... Exporteert Resultaatweergaven op verschillende grafische indelingen (.jpg, .gif, .eps, .png en .svg.) wijzigt of genereert een nieuw ACE-bestand direct geïmporteerd in opgenomen voor vereenvoudigde primerontwerp biedt een nuttige zoomfunctionaliteit faciliteert visuele analyse van assemblies en meta-assemblages, b.v. opmerkingen van respectievelijk recombinaties of verkrijging.


Oslay Gerelateerde software