Oligocheck Controleer de kwaliteit van fylogenetische sondes en primer sets
Download nu

Oligocheck Rangschikking & Samenvatting

Oligocheck Tags

checker sonde U 1016 te downloaden Mario leert typen Sierra Print Shop blauwe tekstmatrix CHM-extractor RXE teamfsd fsd PPM-weergave jungle aap Nokia Krachtige online winkel usextext 4.53 Nokia N91-software N800 Nokia MOV WS PHP-veiling respons 1.7.1

Oligocheck Beschrijving

OligoCHeck is een op Java gebaseerd gereedschap dat is ontworpen om de robuustheid te beoordelen, door een primer set of het fylogenetische bereik van de set of de probe te beoordelen, aangezien het aantal basismismatches met potentiële doelvolgorde toeneemt. De gebruiker levert een primerset of sonde om te controleren, samen met een database van nucleïnezuursequenties. OligoCHeck controleert de primerset of de sonde tegen elke relevante record in de database en neemt toe of er overeenkomsten optreden met een toenemend aantal standaardmismatches toegestaan. De resulterende analyse wordt weergegeven in een grafische vorm naast de sequentie-recordgegevens. Het vermogen van nucleïnezuurprimer sets en sondes om uitsluitend te binden aan de juiste nucleïnezuursequentie is van fundamenteel belang voor de nauwkeurige targeting van specifieke fylogenetische groepen. Een dergelijke specificiteit hangt grotendeels af van de uniciteit van het gebied van nucleïnezuursequentie die dit oligonucleotiden-doelwit is. Hoe unieke de regio, hoe robuuster de primer set of sonde alleen in uitgloeien van het beoogde doelwit, zelfs als variaties in uitgloeiingstemperatuur en andere biochemisch relevante parameters resulteren in de oligonucleotiden die met succes binden met doelen met een of meer basisverschillen. Aldus kan een robuuste primerset of sonde worden bekeken als een die uitsluitend is die uitsluitend is voor het beoogde doel, zelfs wanneer een of meer mismatches zijn toegestaan.

Oligocheck Gerelateerde software