| TFM-Explorer Transcriptiefactor Matrix Explorer |
Download nu |
TFM-Explorer Rangschikking & Samenvatting
- Naam uitgever:
- Bonsai Bioinformatics group
- Besturingssystemen:
- Windows All
TFM-Explorer Tags
TFM-Explorer Beschrijving
TFM-Explorer is een programma voor het analyseren van regelgevingsgebieden van eukaryote genomen. Het duurt een set van coregulated gensequenties en zoekt naar lokaal oververtegenwoordigde transcriptiefactor Bidder-sites. Het algoritme gaat in twee stappen verder: · Scans Sequenties voor het detecteren van alle potentiële transcriptiefactor-bindende sites, met behulp van gewichtmatrices van Jaspar of Transfac · Extracten van significante clusters (regio van de invoersequenties die aan een factor zijn geassocieerd) door een score-functie te berekenen Met TFM-Explorer kan ook de resultaatclusters en hun vermeende transcriptiefactor Bidder-sites op de invoersequenties visualiseren en om naar CIS-regulerende modules te zoeken. Krijg TFM-Explorer en geef het eens om te zien wat het voor u kan doen!
TFM-Explorer Gerelateerde software