TFM-Explorer

Transcriptiefactor Matrix Explorer
Download nu

TFM-Explorer Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Bonsai Bioinformatics group
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 11.3 MB

TFM-Explorer Tags


TFM-Explorer Beschrijving

TFM-Explorer is een programma voor het analyseren van regelgevingsgebieden van eukaryote genomen. Het duurt een set van coregulated gensequenties en zoekt naar lokaal oververtegenwoordigde transcriptiefactor Bidder-sites. Het algoritme gaat in twee stappen verder: · Scans Sequenties voor het detecteren van alle potentiële transcriptiefactor-bindende sites, met behulp van gewichtmatrices van Jaspar of Transfac · Extracten van significante clusters (regio van de invoersequenties die aan een factor zijn geassocieerd) door een score-functie te berekenen Met TFM-Explorer kan ook de resultaatclusters en hun vermeende transcriptiefactor Bidder-sites op de invoersequenties visualiseren en om naar CIS-regulerende modules te zoeken. Krijg TFM-Explorer en geef het eens om te zien wat het voor u kan doen!


TFM-Explorer Gerelateerde software