Genormaliseerde elutietijd (net) voorspellingshulpprogramma Compute voorspelde genormaliseerde elutietijdwaarden voor peptidesequenties
Download nu

Genormaliseerde elutietijd (net) voorspellingshulpprogramma Rangschikking & Samenvatting

Genormaliseerde elutietijd (net) voorspellingshulpprogramma Tags

voorspellen berekenen Genormaliseerde VBR MP3 peptide-kijker peptide compute tijdverschil fragmentatie van peptiden peptidesequentie Peptide-informatie Peptide Fragment Analyzer voorspellen peptide fragmentatie Analyse peptide peptideverdeling peptide hit resultaat peptidemodeller peptide-extractor Peptide-identificatie Maldi-peptide Peptide-statistieken proteotypisch peptide Peptide-evaluatie peptide-aligner Peptide uitlijnen genormaliseerde elutietijd Netto voorspelling Genesspring peptide fragmenten Tijdwaarden toevoegen peptide-analyse

Genormaliseerde elutietijd (net) voorspellingshulpprogramma Beschrijving

Genormaliseerde elutietijd (NET) Voorspellingshulpprogramma is een klein hulpprogramma dat is ontworpen om de voorspelde genormaliseerde elutietijd (netto) waarden voor een lijst met peptidesequenties te berekenen. De elutietijden zijn bedoeld voor gebruik met omgekeerde fase-vloeibare chromatografie (bijv. Met behulp van C18 gecoate siliciumdioxideeltjes) analyses, en worden gebruikt in ons lab voor uitlijning van LC-MS en LC-MS / MS-datasets aan elkaar (met behulp van de voorspelde elutietijden om een master in-Silico-dataset te vormen om elke dataset uit te lijnen). De voorspelde elutietijden worden ook gebruikt door de eiwit-digestie-simulator BASIC bij het berekenen van het aantal unieke identificeerbare peptiden binnen een invoerbestand met behulp van zowel massa als net. Het netto voorspellingshulpprogramma leest de peptiden uit een tekstbestand dat één peptidesequentie op elke regel bevat. Het uitvoerbestand bevat de peptidesequentie plus de voorspelde nettowaarde (en / of voorspelde SCX-waarde) met behulp van een of alle voorspellingsalgoritmen: · Kangas / Petritis LC Retention Time Model · Kangas / Petritis SCX Fraction Model · Krokhin hydrofobiciteitsmodel · Mant hydrofobiciteitsmodel

Genormaliseerde elutietijd (net) voorspellingshulpprogramma Gerelateerde software