WPDB-databasestader Analyseer een 3D-structuur van biologische macromoleculen snel en gemakkelijk.
Download nu

WPDB-databasestader Rangschikking & Samenvatting

WPDB-databasestader Tags

analyse Analyseren vraag analyseer de structuur biologisch netwerk biologisch 3D driehoek maasstructuur Directory-structuur analyseren kristalstructuur analyseren Biologisch netwerk analyseren Analyse 3D-afbeelding Biologische Palindromes 3D-vakwerkconstructie 3D-structuurviewer Biologische screensaver Maak 3D-structuur 3D-structuurontwerp biologische kaart biologische netwerkbeheer Analyse genstructuur Eiwit Data Bank-analyse Analyseer biologische sequenties Analyseer biologisch molecuul 3D-structuur uitlijning Analyseer biologische routes Bekijk 3D-structuur analyseer 3D-structuur analyseren biologische pathway analyseren gegevensstructuur Eiwit 3D-structuur pub file viewer Windows XP-audio Google Maps-software Microsoft Works Agenda poi-loader dAZ loader aandrijflader babylon pro 5 loader 2.0 Pic Loader idm-down loader satellietlader 7 Pica-lader

WPDB-databasestader Beschrijving

WPDB-databasestader is handig, eenvoudig te gebruiken hulpmiddel dat speciaal is ontworpen om u te helpen de driedimensionale structuur van biologische macromoleculen te onderbogen zoals gevonden in de eiwitgegevensbank (PDB) met behulp van query- en display-gereedschappen zoals die hierboven zijn weergegeven. Belangrijkste kenmerken: Wetenschappelijk: Zoek structuren op basis van tekst- en sequenties-zoekopdrachten (mismatches toegestaan). sequentie uitlijning van één registersequentie tegen meerdere doelsequenties volgens de methode van noodleman en Wunsch (JMB 48 (3): 443-453, 1970). Structuur Superpositie met Calpha-posities volgens de methode van Hendrickson (ACTA Crysta35: 158-163, 1979. secundaire structuuropdrachten volgens de methode van Kabsch en Sander. Amino Acid Property Profile Analyse, zowel statische als dynamiek: statisch volgens de waarden gecompileerd door Bogardt et al.; Dynamische, gemiddelde blootstelling Volgens Lee en Richards (JMB 55: 379-400, 1971) en experimentele B-factorenprofielen voor een enkele polypeptideketen of verschilprofielen voor twee uitgelijnde polypeptideketens kunnen worden onderzocht. Neem contact op met de kaartanalyse op verschillende cut-off-afstanden en met verschillende atoomgroepen in contactregelingen of gesuperponeerde structuren (verschil contactkaarten) kunnen worden onderzocht. Typische 3D-weergave en weergave, inclusief opties om substructuren, CPK-weergave, stereo- en eenvoudige oppervlakken (gekleurd op afstand van de gebruiker) te tonen of te markeren. Geometrie-berekening (obligatielen, obligatienaam, dihedrale hoeken, nauwe niet-gebonden contacten) inclusief grafische weergave en afwijkingen van afstanden van kleine molecuul. Computing: -gegevenscompressie - over een 20-voudige vermindering in opslag over de PDB ASCII-bestandsdistributie, maar met: (i) Bibliografische informatie Beperkt tot auteur en JRNL-records; (ii) eventueel de eerste of alle leden van een ensemble van NMR- of modelstructuren inbegrepen; (iii) alleen de eerste alternatieve conformatie zoals gedefinieerd in het PDB-bestand voor delen van een kristalstructuur met gedeeltelijke bezittingen; (iv) atomaire coördinaten afgerond tot 2 en niet op 3 decimalen; (v) Geen PDB-opmerking records. interoperabele weergaveobjecten - Wanneer een functie is geselecteerd in één displayobject (E.GA Contact Map), worden alle andere zichtbare weergaveobjecten (E.G3-D-viewer) en degenen die vervolgens zijn aangeroepen, ook bijgewerkt om die functie te illustreren . Directe toegang tot Raswin het populaire Molecular Display-programma. gesynchroniseerde gedrukte documentatie en contextgevoelige hulp gemaakt met behulp van het DOCTOHELP-pakket.

WPDB-databasestader Gerelateerde software