Microarray Explorer Microarray Explorer (MaExplorer) is een op Java gebaseerde data-mijnbouwfaciliteit voor CDNA- of oligonucleiotide microarray-databases.
Download nu

Microarray Explorer Rangschikking & Samenvatting

Microarray Explorer Tags

verkennen MicroArray Microarray Explorer datamining-faciliteit Microarray-databases

Microarray Explorer Beschrijving

Microarray Explorer (MaExplorer) is een op Java gebaseerde data-mijnbouwfaciliteit voor CDNA- of oligonucleiotide-microarray-databases. Microarray Explorer (MaExplorer) is een op Java gebaseerde data-mijnbouwfaciliteit voor CDNA- of oligonucleiotide-microarray-databases. De verkennend gegevensanalyseomgeving biedt hulpmiddelen voor de data-mining van kwantitatieve expressieprofielen in meerdere microarrays.microarray-gegevens kunnen worden bekeken en direct gemanipuleerd in array pseudoimages, scatter-plots, histogrammen, expressieprofielen, clusteranalyses (vergelijkbare genen, k-middelen of K-mediane, hiërarchische clustering, enz.) en rapporten. Een sleutelfunctie is de gene-filters voor het beperken van een werkreeks genen tot diegenen die een verscheidenheid aan door gebruiksgestelde tests en voorwaarden zijn. Rapporten kunnen worden gegenereerd met hypertekst-webtoegang tot genomische databases zoals Unigenen, Genbank, DBEST, LOCUSLINK, afbeelding, NCI / CIT MADB MICROARRAY-database en andere internetdatabases voor sets van genen die van belang zijn. Een belangrijke focus van deze tool is Interactieve datamining met toegang tot andere ondersteunende webgenomische databases. De nadruk op directe manipulatie van genen en sets genen in grafische tafels biedt een hoog interactie met de gegevens die het gemakkelijker maken voor onderzoekers om ideeën te testen bij het zoeken naar patronen. Hier zijn enkele belangrijke functies van "Microarray Explorer": · Analyseert gegevens (nadat arrays zijn gescand en spots gekwantificeerd) · Handgrepen meerdere cDNA- of oligo-array-monsters met replicatievlekken · Beheert replicerende monsters, met de naam Conditiesets van monsters en lijsten met conditiesets · Beheert de naam subsets van genen · Handgrepen intensiteit of verhouding (CY3 / CY5) gekwantificeerde array-gegevens · Analyseert gegevens voor 2-omstandigheden en n-conditie-expressieprofielen, waaronder ANOVA op een aantal voorwaarden van replicaatsteekproeven · DATA-FILTERS GEN SETSEN DOOR STATISTIEKEN, CLUSTERING, GEN SET-lidmaatschap · Biedt directe data-manipulatie in grafische, spreadsheets en monsterbeheer · Toegang tot genomische webservers van percelen en rapporten · Converteert uw gegevens met behulp van CVT2MAE Data Conversion Wizard · Zowel MaExplorer als CVT2MAE zijn geschreven in Java voor draagbaarheid met downloadinstallateurs die het eenvoudig maken op elk systeem · Gebruikers kunnen deze programma's bijwerken, eenmaal geïnstalleerd, door alleen het JAVA JAR-bestand (en) te downloaden met behulp van update-opdrachten.

Microarray Explorer Gerelateerde software