Seq-gen SEQ-GN is een software die de evolutie van nucleotide of aminozuursequenties langs een fylogenie zal simuleren.
Download nu

Seq-gen Rangschikking & Samenvatting

Seq-gen Tags

opeenvolgingen sequentiepositioneringen aminozuursequenties nucleotidesequenties aminozuur nucleotide

Seq-gen Beschrijving

SEQ-Gen is een software die de evolutie van nucleotide of aminozuursequenties langs een fylogenie zal simuleren. SEQ-GEN is een software die de evolutie van aminozuur of nucleotidesequenties langs een fylogenie zal simuleren, met behulp van gemeenschappelijke modellen van het substitutieproces. Een reeks modellen van moleculaire evolutie wordt geïmplementeerd, inclusief het algemene omkeerbare model. Staatsfrequenties en andere parameters van het model kunnen worden gegeven en locatiespecifieke heterogeniteit van de snelheid kan ook in een aantal manier worden opgenomen. Elk aantal bomen kan worden gelezen en het programma zal elk aantal gegevenssets voor elke boom produceren. Aldus kunnen grote sets repliceren simulaties eenvoudig worden gemaakt. Het is ontworpen om een algemene simulator te zijn die de meeste van de veelgebruikte (en computationaal tractabele) modellen van moleculaire sequentie-evolutie omvat. Wat is er nieuw in deze release: fixed: · De PAM (Dayhoff) en Blosum Matrices werden verwisseld Men zou resulteren in de andere die in plaats daarvan wordt gebruikt.

Seq-gen Gerelateerde software