Splitsing Split-dist berekent het aantal splitsingen (randen) die verschilt voor twee bomen.
Download nu

Splitsing Rangschikking & Samenvatting

Splitsing Tags

berekenen Newick-indeling Newick bereken splitsingen bereken randen Split-Afst

Splitsing Beschrijving

Split-dist berekent het aantal splitsingen (randen) die verschilt voor twee bomen. Split-dist berekent het aantal splitsingen (randen) die verschilt voor twee bomen. Het Split-dist-programma, SDIST leest in een reeks bomen in Newick-formaat en berekent welke van de randen / splitsingen er tussen worden gedeeld. Het resultaat wordt gegeven in de vorm van een matrix, waarbij de invoer I, J het aantal randen in de boom I geeft die ook in boom wordt aangetroffen J.Statistics over de splitsingen die niet worden gedeeld tussen twee bomen kan ook worden berekend. Dit gebeurt door te overwegen, voor elke niet-triviale split-splitsingen met meer dan een bladelement aan beide zijden van de rand - de grootte van de kleinste van de twee sets in de Split A | b. De maximale, minimale en middelengrootte van de kleinste set in de splitsingen die niet worden gedeeld, worden berekend en gerapporteerd. Deze statistieken geeft een indicatie van hoe "lokale" de verschillen tussen de twee bomen zijn - als de kleinste set klein is, geeft de rand die verschilt een verschil in een kleine subboom, als de set groter is, is het verschil groter . De tool kan ook de reeks splitsingen in elke boom berekenen (met een telling van hoe vaak de splitsing wordt gevonden) en de reeks splitsers gedeeld door alle bomen in de set. Informatie over welke splitsingen in één boom ook in de Andere bomen kunnen worden gerapporteerd in een geannoteerde boom. Deze boom, uitvoer in Newick-formaat, heeft dezelfde topologie als de eerste boom, maar de randen zijn geschreven als subboom F: filiaallengte, waarbij F de fractie is van de bomen die de rand bevat, dat wil zeggen, ie, 1 als het Rand wordt ondersteund door alle bomen of 0,5 als slechts de helft van de bomen de rand bevat. Installatie: het split-dist-pakket is geschreven in C ++. Het moet op elk Unix-achtige systeem compileren. Als u het pakket wilt installeren, downloadt u de broncode en pakt u deze uit (TAR XZF SPLIT-DIST-ABCTAR.GZ, waarbij ABC het versienummer van SPLIT-DIST is), vervolgens het configureren en maken in de SUBDIRECTORY SPLIT-DIST-ABC Creëren tijdens het uitpakken. Dit creëert het Split-dist-programma, de SDIST samen met een aantal testprogramma's. Om te controleren of alles goed is gegaan, voer je het controleren. Installeer het SDIST-programma als alle tests passeren door installatie te maken. Lees het installatiebestand voor meer info.Wat is nieuw in deze release: · Een ontbrekende virtuele destructor was opgelost.

Splitsing Gerelateerde software