Herhalingsfinder
REPEATFEINDER IS EEN GEBASEERDE BIOINFORMATICS-tool die zoekt naar herhaalde stukken DNA. ...
 | TransposonpsiTransposonPSI is een analysetool om eiwit- of nucleïnezuursequentie-homologie te identificeren. |
| Download nu | |
Transposonpsi Rangschikking & Samenvatting
Advertentie
Transposonpsi Tags
Transposonpsi Beschrijving
Transposonpsi is een analysetool om eiwit- of nucleïnezuursequentie-homologie te identificeren. Transposonpsi is een analysetool om eiwit- of nucleïnezuursequentiehomologie te identificeren aan eiwitten die zijn gecodeerd door diverse families van transponeerbare elementen. PSI-BLAST wordt gebruikt met een verzameling (retro-) transposon-ORF-homologieprofielen om statistisch significante uitlijningen te identificeren. Deze methode kan worden gebruikt om potentiële transposon-orf's binnen een eiwitreeks te identificeren of om regio's van transposonhomologie binnen een grotere genoomsequentie te identificeren of te identificeren . Dit is in het bijzonder nuttig om gedegenereerde transposon-homologieën te identificeren binnen genoomsequenties die ontsnappen aan identificatie en maskeren door het gebruik van REPEATMASKER en een bijbehorende nucleotidebibliotheek van repetitieve elementen.Transposonpsi is routinematig gebruikt bij het Instituut voor Genomic Research om te helpen bij de ontdekking van mobiele elementen tussen eukaryoten inclusief protozoa, planten, schimmels en dieren. Vereisten: · NCBI Blast, inclusief Blastall en BlastPGP · Bioperl
Transposonpsi Gerelateerde software
Gekko hamaker
Gecko Hamaker is een database-applicatie die loopt met behulp van MySQL, een open source-database beschikbaar voor gratis download. ...
Geonetwork
Geonetwork is een open source-catalogusaanvraag om ruimtelijk referentie-bronnen via internet te beheren. ...