TESD Simuleert het aantal genomische kopieën in verschillende populaties in generaties
Download nu

TESD Rangschikking & Samenvatting

TESD Tags

simuleren simulator Genomische regio methylatie genomische methylatie Bekijk genomische informatie Analyseer genomische informatie genomische informatie viewer Bekijk genomische gegevens genomische data viewer Ontdek genomische gegevens genomische sequentie van zoogdieren genomische simulator genomische simulatie elementsimulator genomisch Wright-fisher-generaties toegang tot genomische diversiteit genomische datasimulatie genomische gegevens analyseren genome structuurvariatie Genomische loci Genomic Annotator

TESD Beschrijving

De naam TESD-standaard voor Transposable Element Simulator Dynamics. TESD is ontwikkeld om een wetenschappelijke toepassing te zijn. TESD simuleert het aantal genomogene-TE-kopieën in verschillende populaties in generaties (volgens het eilandmodel), met behulp van klassieke modellen van Te Dynamics. De parameters van de modellen (omzetting en excisentarieven, selectie-intensiteit, recombinatiepercentage, migratiesnelheid, bevolkingsmaten en aantal populaties) worden door de gebruikers gedefinieerd. Om het gebruiksvriendelijker te maken heeft TESD een grafische interface. Gebruikers kunnen de verschillende parameterwaarden instellen met behulp van formulieren die vragen stellen. De resultaten van de simulaties worden gevisualiseerd dankzij ingebouwde grafische hulpmiddelen, met behulp van de JFREECHART-bibliotheek. TESD biedt een volledige applicatie waarmee Modellers andere modellen van Te Dynamics implementeert. TESD wordt geïmplementeerd in Java, een objectgerichte taal die gemakkelijk kan worden uitgebreid en dit betekent dat TESD op alle besturingssystemen kan worden uitgevoerd (Linux, Mac, Windows, Solaris, enz.).

TESD Gerelateerde software