Prosat eiwit residu annotation toolkit
Download nu

Prosat Rangschikking & Samenvatting

Prosat Tags

annotatie Annotatie-plug-in Annotatie SDK Annotatie ActiveX eiwit video annotatie op te halen eiwit analyseren eiwit vergelijk eiwit PDF-annotatie geometrische annotatie Semantische annotatie annotatie van de grafiek eiwitmolecuul annotatiebibliotheek annotatieprocessor Beeld annotatie Lexicale cohesieannotatie Semi-geautomatiseerde annotatie annotatie luisteraar RESTAASY annotatie Debugging symboolannotatie annotatie cli Tekstannotatie maak annotatie eiwitidentificatie Eiwitsynthesizer Eiwitkristallisatie eiwit translocatie eiwitlijst eiwitvisualisatie sequentie annotatie annotatietool Nummer annotatie robijn annotatie site annotatie bekijk annotatie eiwit extractie annotatieproces Transcriptannotatie Eiwitstructuren Verfijning Eiwitstructuur Geometrische eiwitkenmerken chromosomale annotatie gen annotatie Beeld annotatie ANNOTATIE Annotatie toewijzen Codeannotatie Audio-annotatie gereguleerde eiwitaludatie Valideer gereglementeerd eiwit Eiwitviewer kwadratisch residu kwadratisch non-residu residu Minste kwadratisch non-residu annotatie van het discours annotatie mapper annotatie analyzer Intuïtieven annotatie Analyse eiwit-database Eiwitevolutie Eiwittest Annotatie eiwitdichroïsme Eiwitstructuren Gegevensannotatie Ontologie-gebaseerde annotatie Eiwitresten Aminoacid Residu SVM Builder functionele annotatie CDNA-annotatiesysteem Evalueer eiwitcomplex Eiwitcomplex voorspelling Bekijk eiwitcomplex residu procent aminozuurresidu Eiwitbrowser Bereid structuurannotatie voor Brookhaven Protein Data Bank annotatie-editor eiwit bekijken Bekijk eiwitbestand Eiwitanalysator Wereld wind annotatie annotatie weergeven annotatie maken Plaats annotatie Kaartannotatie annotatiecontrole Bekijk eiwitsequenties Eiwitsequenties Viewer Nucleotide-annotatie eiwitevolutie simuleren Protein Evolution Simulation Eiwit uitlijnen Visualiseer eiwit Mascotte eiwit Pieknotatie Eiwit interactie render eiwit Bekijk eiwitbestanden Beheer de eiwit-databank Eiwit-vizualistisch Eiwit 3D-structuur annotatie verwijderen kodak annotatie hoe te spelen xharbour ActiveX XLS naar DTD DivX Codec Linux Toshiba Video Controller karaoke-liedjes voor onfreeze 7.00.020.3172 ZWECKFORM CD-label autocad 2008 naar beneden ISO R773 PDF

Prosat Beschrijving

De PROSAT-toolkit is ontwikkeld om een reeks programma's te zijn die het bouwen van SVM-gebaseerde modellen voor het annoteren van aminozuurresiduen in eiwitsequenties gebruiken met behulp van gebruikte functies van de gebruiker (zoals PSI-BLAST-profielen of PSIPRED-profielen). In het bijzonder bouwt de toolkit functies op met behulp van een venster rond het residu, en is uitgerust met een gespecialiseerde kernel-functie (genormaliseerde tweede orde exponentiële kernel-functie NSO), samen met de standaard SVM-kernel-functie. PROSAT_LEARN is het programma om "n" one-versus-rustclassificatiemodellen te leren, waarbij n het mogelijke aantal annotaties zijn. Het kan ook een ondersteuning vectorregressiemodel leren om een drijvende puntwaarde te voorspellen. Gebruik Prosat_learn PROSAT_PREDICT is het programma om de annotatie voor elk residu uit de gebouwde modellen te voorspellen en een L XN-dimensieprofiel uit te voeren, de score uit elk van de N One-versus- Rest SVM-modellen voor elk aminozuurresidu en L zijn de lengte van de eiwitsequentie. In het geval van een regressiemodel, n = 1. Gebruik Prosat_predict Invoer PROSAT_PREDICT heeft drie vereiste parameters: - Testbestand: het testbestand biedt de lijst met reeksfuncties waarvoor we de annotatieprofielen moeten voorspellen. Het is vergelijkbaar met het invoerbestand dat wordt gebruikt in Prosat_Learn, behalve dat het niet de namen van de echte annotatiebestanden bevat, omdat we voorspellen hetzelfde. - Modelbestand: het modelbestand is het modelbestand uitgegeven door Prosat_Learn - Voorspellingsbestand: het voorspellingsbestand biedt het pad en het voorvoegsel van de uitvoervoorspellingen in de vorm van annotatieprofielen. Uitgang De uitgang bestaat uit een reeks voorspelde annotaties en profielen, die niets anders is dan de SVM-voorspellingen van elk van het "NUM-element" SVM-modellen.

Prosat Gerelateerde software